单细胞RNA-seq数据的全面质量控制和交互式分析
2023-11-13 14:29:50深情的哈密瓜
在本次网络研讨会中,JoshuaCampbell将讨论scRNA-seq分析的基础知识以及如何应对各种挑战。
科学家使用单细胞RNA测序(scRNA-seq)来深入了解复杂组织内的细胞异质性。scRNA-seq数据中可能存在各种技术工件,应在进行下游分析之前进行评估。在本次技术讲座中,JoshuaCampbell将讨论scRNA-seq分析的基础知识以及应对各种挑战的适当方法。
学习目标
单细胞RNA-seq分析的全面质量控制
空滴与真细胞的分离
去除劣质细胞
双联体检测
环境RNA估计
scRNA-seq数据的下游分析
与样本水平表型的关联
自动细胞标记
基因集富集
细胞间通讯分析
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