单细胞RNA-seq数据的全面质量控制和交互式分析

2023-11-13 14:29:50深情的哈密瓜

在本次网络研讨会中,JoshuaCampbell将讨论scRNA-seq分析的基础知识以及如何应对各种挑战。

单细胞RNA-seq数据的全面质量控制和交互式分析

科学家使用单细胞RNA测序(scRNA-seq)来深入了解复杂组织内的细胞异质性。scRNA-seq数据中可能存在各种技术工件,应在进行下游分析之前进行评估。在本次技术讲座中,JoshuaCampbell将讨论scRNA-seq分析的基础知识以及应对各种挑战的适当方法。

学习目标

单细胞RNA-seq分析的全面质量控制

空滴与真细胞的分离

去除劣质细胞

双联体检测

环境RNA估计

scRNA-seq数据的下游分析

与样本水平表型的关联

自动细胞标记

基因集富集

细胞间通讯分析

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