糖分析可以揭示不同类型的癌症

2023-12-14 14:40:24深情的哈密瓜

将来,一点唾液可能就足以检测出早期的癌症。哥德堡大学的研究人员开发出一种有效的方法来解释癌细胞中糖分子的变化。

糖分析可以揭示不同类型的癌症

聚糖是一种糖分子结构,与我们细胞中的蛋白质相连。聚糖的结构决定了蛋白质的功能。人们早就知道聚糖结构的变化可以表明体内的炎症或疾病。

现在,哥德堡大学的研究人员已经开发出一种区分不同类型结构变化的方法,这可能为特定疾病的变化提供准确的答案。

“我们分析了大约 220 名患有 11 种不同诊断癌症的患者的数据,并根据癌症类型确定了聚糖子结构的差异。通过让我们新开发的方法在人工智能增强的情况下处理大量数据,我们我们能够找到这些联系。”哥德堡大学生物信息学副高级讲师、《细胞报告方法》杂志上发表的这项研究的主要作者 Daniel Bojar 说道。该论文的标题是“用一套差异表达分析方法解码糖组学”。

AI增强方法发现模式

还有其他研究小组研究聚糖的子结构,寻找描述问题所在的所谓生物标志物。这通常涉及使用质谱进行统计测试,以确定癌症中单个糖的水平是否显着升高或降低。这些测试的灵敏度太低且不可靠,因为不同的糖在结构上相关,因此彼此不独立。

Daniel Bojar 的研究团队使用了一种包含人工智能的新方法,该方法将这些问题考虑在内,并可以在数据集中找到其他人失败的模式。

“我们可以信赖我们的结果;它们具有统计显着性。如果我们知道我们在寻找什么,就更容易找到正确的结果。现在我们将利用这些生物标志物并开发测试方法,”丹尼尔·博贾尔说。

新型质谱仪

秋天,他的研究小组购买了一台最先进的质谱仪。该仪器将作为人工智能平台,支持研究人员进行聚糖研究,例如肺癌样本中的聚糖研究。目的是尽早发现癌症,以提高康复的机会。

“我们希望开发一种可靠且快速的分析方法,通过血液样本或唾液来检测癌症以及癌症的类型。我认为我们也许能够在四到五年内对人体样本进行临床测试,”说丹尼尔·博贾尔.

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