解码复活节兔子芬兰东部棕兔代表物种基因组标准

2024-03-21 09:38:26深情的哈密瓜

东芬兰大学环境与生物科学系的野兔研究小组发表了欧洲棕兔染色体组装的参考基因组。参考基因组代表了物种基因组的一种标准,可以将物种的任何基因组数据与之进行比较。

解码复活节兔子芬兰东部棕兔代表物种基因组标准

传统上,组装参考基因组非常困难,因为它们需要构建染色体的细胞遗传学和连锁图谱,这就是为什么它们仅适用于人类和一些用于研究的众所周知的模式生物。

然而,最近的技术进步使得新方法能够重建染色体结构并鉴定其基因内容。本研究还利用这些方法对来自芬兰东部利佩里的一只棕色雄性野兔的参考基因组进行了测序和组装。

基因组由 29 亿个碱基对组成,形成 23 条常染色体以及 X 和 Y 性染色体。总共鉴定了 30,833 个基因,其中 21,467 个是蛋白质编码基因。相比之下,人类基因组稍大(31 亿个碱基),但蛋白质编码基因较少(20,080 个)。

棕色野兔代表了欧洲参考基因组图谱计划中芬兰物种的第一个基因组,该计划旨在为所有欧洲真核物种生成参考基因组。

参考基因组能够并促进未来对该物种的多种类型的研究,因为来自该物种的任何 DNA 序列数据都可以通过与参考基因组进行比较来快速识别。此外,研究人员可以寻找和识别基因组中任何有趣的部分,例如单个基因,并利用它们来计划和进行研究。

与目前正在准备的山兔参考基因组一起,褐兔基因组已经为进化史、生理适应和种群调查开辟了新的研究途径。开放获取的基因组数据和相关研究也将加速该领域的发展,产生新知识、实际应用和创新。

基因组发布的时机非常合适,因为棕色野兔也代表了欧洲民间传说中熟悉的原始复活节兔子。虽然对于复活节兔子的起源和象征意义存在相互矛盾的说法,但早在起源于伊比利亚半岛的兔子流行之前,棕色野兔就在欧洲大陆很常见。

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