使用核小体为抗体生产设定高标准

Michael-ChristopherKeogh对表观遗传学和染色质生物学的热情帮助科学家解决复杂的研究问题并克服健康科学进步的挑战。Keogh本人曾是一名学术科学家，现在是EpiCypher的首席科学官，EpiCypher是一家生物技术公司，支持跨越整个创新和商业化周期的变革性临床突破——从从事基础探索工作的学者到提供尖端健康创新的公司。

你作为科学家的旅程是怎样的?

一开始，我对转录和基因表达很感兴趣。当时该领域的每个人主要都在研究裸露的DNA、一些遗传学和大量的生化知识。我们都会忽略这样一个事实，即转录不是发生在裸露的DNA模板上，而是发生在细胞内。这个过程被染色质化——与组蛋白结合成核小体。当第一个转录激活因子被明确确定为组蛋白修饰剂时，我立即开始研究染色质和表观遗传学，然后对所有DNA事务产生了更广泛的兴趣，包括基因表达、损伤修复、端粒维持和染色体传递。

我曾在纽约阿尔伯特爱因斯坦医学院担任助理教授几年，然后决定我不适合学术轨道。一些同事邀请我加入他们的新公司EpiCypher，从那以后我就爱上了它。EpiCypher是一家表观遗传学和技术开发公司。我们支持进行早期研究以识别新蛋白质家族并揭示突变与疾病之间关联的学者，以及已经针对不同表观遗传靶点提供多种临床批准药物的药物开发人员。EpiCypher支持整个生态系统，使用核小体作为底物和基因组作图控制。

您的工作解决的主要研究挑战是什么?

一个重点是建立一个独立的测试平台，以确定每个人都花费数百万美元购买的组蛋白翻译后修饰(PTM)抗体是否符合目的。我们发现大多数情况并非如此，而且在许多情况下，即使抗体达到了它的承诺，也很难确保稳定的供应。抗体通常是通过对兔子进行免疫来开发的，并以单一目录号的形式向世界推出。该领域在很大程度上忽略了这些试剂的不同批次之间固有的生物学差异，即使对于重组单克隆抗体也是如此。我们评估这些试剂的性能，证明给定的抗PTM抗体适合我们直接测试核小体标准的方法。我们选择一流的技术来实现变革性基因组技术，重点是表观遗传学和染色质。除此之外，我们不做任何承诺。我们知道抗体并不是万能的。我们向最终用户开放关于如何使用可以独立验证的定义和完全透明的标准来验证每种抗体的特定应用程序。

您如何使用Fortis(Bethyl)抗体来帮助应对这一挑战?

每个人都知道如何制造抗PTM抗体。它们是由多家公司开发和销售的商品。但我们经常看到能力上的巨大差异，因为这些试剂通常仅针对组蛋白肽进行培养、测试和验证。从未考虑过核小体。Bethyl采取了不同的方法，将我们的技术与他们的技术一起实施，他们正在做的事情正在发挥作用。Bethyl用肽对兔子进行免疫和初步筛选，然后将候选者暴露于我们的核小体以确定它们如何处理这些染色质亚基。然后将克隆产品运送到EpiCypher以进一步测试PTM定义的核小体对照面板，之后选择性能最佳的候选物用于感兴趣方法的放大和最终验证。然后，EpiCypher将发布所有用于创建这些试剂的数据——本质上，我们将准确展示每种抗体的功能，并将以相当的严格性检查每一批次。我们一直对Bethyl最初的候选人成功率感到满意。他们在工作流程中富有创造力，对我们的输入反应灵敏，并且是一个非常棒的整体合作团队。我们现在正在进行多个项目，多个抗PTM克隆将作为正式的基因组作图试剂推出。