用于可视化牛物理遗传图谱的应用程序

2023-07-19 09:33:48冷酷的灯泡

物理图谱是在基因组研究中创建的,用于说明遗传信息如何在单个染色体上排列。此外,遗传图谱显示了遗传变异从父母之一一起遗传给后代的概率。

用于可视化牛物理遗传图谱的应用程序

高分辨率基因图谱在科学中有许多应用:它们有助于统计分析,以找到与某些表现或健康特征相关的遗传变异。它们还可以用来计算动物之间的亲缘关系以及繁殖种群的规模。这正是遗传图谱不仅与研究相关,而且与动物育种和牲畜种群管理相关的原因。遗传图谱对于制定现代育种策略和维护动物资源以确保遗传多样性是必不可少的。

基于德国荷斯坦牛和德国/奥地利弗莱克维牛的大量数据,农场动物生物学研究所 (FBN) 开发了一个平台,允许用户交互式探索这些牛品种的物理遗传组合图谱。

交互式 CLARITY 应用程序是教育和研究的宝贵工具

通过不断整合不同牛品种的数据,该应用程序还可以进行比较并可视化遗传多样性。因此,CLARITY 是牛基因组教育和研究的宝贵工具,并且可以扩展到包括其他动物物种。通过直观设计的用户界面,用户只需单击即可选择和自定义各个功能。结果可以通用格式下载并免费使用(许可证 CC-BY 4.0)。

“该应用程序不是静态的信息目录。它为用户提供了独特的可能性,可以根据自己的想法思考进入遗传图谱的方式。例如,可以选择基因组区域或感兴趣的区域,从而更有可能重组遗传变异可以扩大,”Dörte Wittenburg 博士解释道,他与 FBN 的国际科学家团队合作开发了该应用程序。

“牛育种协会立即被这个项目说服,并提供了数十万只动物的遗传数据,因此结果具有很高的准确性,”维滕伯格博士解释道。该应用程序的众多功能在《遗传学前沿》杂志上发表的一篇论文中进行了描述。

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