改善肝癌的诊断和治疗

卡罗林斯卡学院的研究人员表示，他们已经确定了肝癌中蛋白质和 lncRNA 分子之间存在特定的联系。通过增加lncRNA分子的存在，肿瘤细胞的脂肪库减少，从而导致肿瘤细胞停止分裂，并最终死亡。

科学家们表示，发表在《肠道》杂志上的这项研究(“ CCT3-LINC00326 轴调节肝癌脂质代谢”)有助于增加知识，从而有助于更好的诊断和未来的癌症治疗。

研究人员写道：“为了更好地理解癌细胞的转录表型，我们对 RNA 结合蛋白 (RBP) 进行了全面表征，以识别改变的 RNA，包括长非编码 RNA (lncRNA)。”

“为了揭示癌症中的 RBP-lncRNA 相互作用，我们整理了人类细胞中约 2,300 个高表达 RBP 的列表，在多个队列中测试了 RBP 和 lncRNA 对患者生存的影响，改变了表达水平，并整合了各种测序、分子和细胞数据。

“RBP 的高表达对 21 种癌症类型的患者生存产生负面影响，尤其是肝细胞癌 (HCC)。在敲低前 10 个上调的 RBP 并随后进行转录组分析后，我们鉴定了 88 个差异表达的 lncRNA，其中包括 34 个新转录本。CRISPRa 介导的四种 lncRNA 的过度表达对 HCC 细胞表型和转录组有重大影响。对四个 RBP-lncRNA 对的进一步研究揭示了参与不同的调控过程。

“最明显的 RBP-lncRNA 连接影响脂质代谢，因此非经典 RBP CCT3 以不依赖伴侣蛋白的方式调节 LINC00326。CCT3-LINC00326 调控网络的扰动导致纤维素中脂质积累减少和脂质降解增加以及体内肿瘤生长减少。

“我们发现，RBP 基因表达在 HCC 中受到干扰，并发现 RBP 在正常生理条件下发挥超出其任务的额外功能，这些功能可以通过 lncRNA 刺激或增强，从而影响肿瘤生长。”

“在肝癌患者捐赠的组织材料的帮助下，我们已经能够绘制基因组的编码和非编码部分图谱，以确定哪些RNA结合蛋白在肝癌细胞中大量存在，”该研究的资深作者、卡罗林斯卡学院微生物学、肿瘤和细胞生物学系研究员克劳迪娅·库特博士说。“我们发现许多这些蛋白质与一种长类型的非编码 RNA 分子(即所谓的 lncRNA)相互作用。”

研究小组对 RNA 结合蛋白 (CCT3) 和 lncRNA 分子 (LINC00326) 的特定配对进行了更详细的研究。利用先进的 CRISPR 技术，他们能够减少和增加蛋白质和 lncRNA 的量，以了解它如何影响癌细胞。当lncRNA增加时，肿瘤细胞的脂肪库减少，细胞分裂停止，许多癌细胞死亡。实验室研究之后，结果也在体内得到验证。

研究人员的发现提供了对RNA结合蛋白和lncRNA分子之间相互作用的深入了解，并有助于更好地科学理解它们在肿瘤中的作用。

“CCT3-LINC00326 对的活性已经可以用于肝癌的诊断和预后，”该研究的第一作者、Kutter 研究小组的研究员 Jonas Nørskov Søndergaard 博士说。“然而，对这种特殊配对的了解只是一个开始，我们将进一步研究更多的 RNA 结合蛋白和 lncRNA 分子的组合。从长远来看，这些发现有助于开发新的有效治疗方法，例如仅针对患病细胞的基于 RNA 的治疗方法，并有可能减少副作用。”