研究人员创建了EpiCDog这是犬类表观遗传学的参考工具

韩国首尔国立大学兽医学院的研究人员为狗创建了一个可浏览的表观遗传图谱，名为EpiCDog(狗的表观基因组目录)，以协助未来的研究工作。

发表在《科学进展》上的论文《狗表观基因组的综合作图：比较组织间和跨物种研究的参考注释》详细介绍了用于全面了解犬表观遗传因素的方法。

表观遗传学是指在不改变底层DNA序列的情况下发生的基因表达变化。这些变化可能受到饮食、环境条件、生活方式选择和心理压力等多种因素的影响，并可能遗传给后代。

家犬，又称家犬，是一个令人着迷的表观遗传学研究物种，因为它们与人类共享大多数环境条件。通过人类性状选择人工培育出数百个品种。

历史上从来没有出现过大量野生小猎犬在开阔的平原上追赶野牛的情况，也没有出现过咆哮的哈巴狗群阻止剑齿虎捕食新驯鹿的情况。这是所有家养狗的共同祖先灰狼留下的。

虽然驯化始于20,000多年前，但我们今天认识的大多数狗品种都是在大约150年前在英国培育出来的。在维多利亚时代，独特的狗品种变得非常流行，杂交育种也在狗的“维多利亚爆炸”中加剧。

从形态到行为的表型特征的快速多样化都存在于狗的基因组中，可以从进化和表观遗传效应中学到许多教训。

研究人员进行了全基因组分割和功能注释，以生成参考狗表观基因组。两个数据集重复包括RNA测序、染色质免疫沉淀(对5个主要组蛋白标记进行测序)以及从三只成年小猎犬收集的11种组织类型的结合域测序。

选择比格犬是因为它们是人类癌症研究不可或缺的一部分。在持照兽医的指导下，研究小组采集了大脑、小脑、结肠、肾脏、肝脏、肺、乳腺、卵巢、胰腺、脾和胃的活检组织。这些组织类型的选择主要基于肿瘤发生风险和患病率，以优先考虑比较肿瘤学研究的实用性。

来自组织样本的序列数据与转录水平的计算数据集成相结合，用于全基因组功能注释、染色质状态发现和下游表观基因组分析。

通过对狗表观基因组的可靠定义，使用人类和小鼠ENCODE数据进行分析使团队能够将狗的观察结果与人类和小鼠表观基因组活动的现有知识联系起来。

对跨物种基因表达模式的聚类和分析显示了组织特异性和物种特异性聚类，为了解人类、小鼠和狗基因表达的保守性和差异提供了见解。

EpiCDog参考资料(目前在GitHub上)提供了狗的表观基因组目录，可用于以狗为模型的人类医学研究中的比较生物学以及犬类疾病的兽医医学研究。